間違えて登録したデータを修正・削除しても大丈夫ですか？

はい、問題ありません。 

電帳法で禁止されているのは「こっそり書き換えること（改ざん）」です。本システムでは、いつ、誰が、どの項目を修正したかという「訂正・削除の履歴」が自動的に記録される仕組みになっています。

この履歴が残ること自体が「真実性の確保」の証明になるため、安心して正しい内容に修正してください。

※詳細は国税庁のサイト、または顧問税理士様にご確認ください。