「2ヶ月＋7営業日」を過ぎると、システム上で何か制限がかかりますか？

システム上の制限（アップロード不可など）はかかりません。

期限を過ぎた証憑の登録をブロックすることはありません。

ただし、アップロードした日時はNTPサーバー（正確な時刻情報）によって自動的に記録されるため、後から保存日（アップロード日）を遡って記録することはできません。